Bioinformaticien ou Bioinformaticienne - 100%
Key information
- Publication date:02 November 2024
- Workload:100%
- Contract type:Permanent position
- Place of work:Genève
Avec plus de 12'000 collaborateurs et collaboratrices représentant 160 métiers, les Hôpitaux Universitaires de Genève sont un établissement de référence au niveau national et international. Pour en savoir plus sur notre institution, prenez quelques minutes pour consulter notre rétrospective 2023 en cliquant ici .
Le poste est rattaché au Département diagnostique . Ce département, composé de neuf services médicaux, a pour mission de fournir des diagnostics, produits thérapeutiques, actes thérapeutiques, et consultations cliniques spécialisées, de haute qualité médicale, dans les meilleurs délais et à un coût acceptable, pour orienter la prise en charge des patientes et patientset contribuer aux décisions et gestes thérapeutiques.
Le Service de médecine génétique (SMG) est à la fois clinique, avec des consultations, et de laboratoire. Il s'occupe principalement de conseils génétiques et thérapeutiques aux patients et patientes, basés sur les résultats des analyses génétiques réalisées dans ses laboratoires, avec notamment des méthodes modernes de cytogénétique et de diagnostic moléculaires incluant le séquençage à haut débit de l’ADN. Les prestations offertes assurent principalement le diagnostic, le pronostic et la prédiction de maladies héréditaires. La bioinformatique y occupe une place toujours grandissante. Le service a aussi des missions de recherche et d'enseignement.
Les laboratoires du Service de médecine génétique (cytogénomique; diagnostic moléculaire) effectuent des analyses génétiques diagnostiques, y compris le séquençage de génome complet (whole genome sequencing, WGS).
En tant que bioinformaticien ou bioinformaticienne, vous rejoignez une équipe de génétique clinique. Vous avez une solide expérience en bioinformatique et un intérêt pour l’analyse des données génétiques afin de contribuer à des diagnostics précis et à des recherches innovantes.
Vous traitez et analysezles données bioinformatiques de séquençage ou issues d'autres méthodes à haut débit, à des fins diagnostiques, en collaboration avec les médecins et les biologistes responsables.
Vous organisez, gérez, actualisez et maintenez l'infrastructure bioinformatique (pipelines d’analyses) au sein des laboratoires concernés.
Mettant au point de nouveaux outils et processus numériques permettant d'organiser, de comparer, d'analyser, de diffuser des données omics/moléculaires de médecine, vous contribuez aux efforts de bioinformatique du SIB (institut suisse de bioinformatique) selon la convention établie entre les HUG et le SIB.
Vous assurez la veille technologique et méthodologique dans le domaine de la bioinformatique et de la génétique clinique.
Vous participez à la rédaction de rapports scientifiques, de publications et éventuellement, selon accord en vigueur, vous enseignez la bioinformatique et la génétique médicale à la faculté de médecine.
QualificationsVous êtes titulaire d'un Master ou PhD/ DrSci en bioinformatique. Vos connaissances en biologie et en génétique sont un atout.
Vous maîtrisez les langages de programmation courants (Python, snakemake, R, Bash).
Vous avez des connaissance des bases de données génomiques (ClinVar, gnomAD,…) et des outils bioinformatiques (SAMtools, MultiQC, GATK,…).
Vous avez une expérience avérée en informatique, en analyse de données génomiques et en développement de pipelines bioinformatiques. (Perl, R, et/ou C++, automatisation de pipelines sur plateforme Unix, analyse de données de séquençage NGS, détection de mutations ou de variants structurels du génome).
Vous possédez d'excellentes compétences en communication et la capacité à travailler en équipe.
Informations supplémentaires- Entrée en fonction : 01.01.2025
- Nombre de postes : 1
- Taux d’activité : 100%
- Classe de fonction : 19
- Contrat : CDI
- Délai de candidature : 16.11.2024
- Demande de renseignements : ProfesseurM. Abramowicz,médecin-chef de service, tél. 022 372 18 61
Votre dossier de candidature doit comporter une lettre démontrant votre motivation, votre curriculum vitae, les copies des diplômes et attestations requis pour le poste.
Cette annonce s'adresse indistinctement aux femmes et aux hommes.
Souhaitant s’engager dans la lutte contre le chômage, les HUG encouragent les candidatures qui proviennent de l’Office cantonal de l’emploi.
